Tým odborníků je o krok blíže k oživení vlněného mamuta díky první trojrozměrné rekonstrukci DNA 52 000 let starého mamuta. Srstnatý mamut byl lyofilizován počasím hned poté, co zemřel, a jeho DNA se zachovala ve stavu podobném sklu. Neobvykle dobře zachovalý exemplář byl vykopán na severovýchodní Sibiři v roce 2018, což umožnilo mezinárodnímu týmu vědců analyzovat jeho kožní tkáň.
Podle tiskové zprávy výzkumníci sestavili 3D genomové a chromozomové struktury 52 000 let starého mamuta srstnatého. Taková věc se povedla vůbec poprvé.
Srstnatý mamut „Yuka“ okamžitě po smrti zmrzl. Permafrost uchoval jeho chromozomy ve více skelném stavu. Pozoruhodný a neobvyklý zkamenělý tvor poskytl „nejživější“ obraz starověké DNA, jaký byl kdy zachycen.
Většina nalezených vzorků jsou fragmenty nebo kusy. Výzkumníci uvedli v prohlášení: „Naše studie ukazuje, že starověká morfologie chromozomů je zachována ve vzorcích mamutího permafrostu z doby před 52 000 lety, což umožňuje sestavení genomu a transkriptomickou analýzu vyhynulých druhů.“
Erez Lieberman Aiden , odpovídající autor studie, uvedl v prohlášení: „Toto je nový typ fosílie s milionkrát více sekvencí. Je to také poprvé, co byl pro starověký vzorek určen karyotyp [kompletní sada chromozomů] jakéhokoli typu.“
Studie: řešení starověké hádanky
Mapování DNA mamuta srstnatého bylo téměř jako řešení skládačky „tři miliardy dílků“. Vědci museli vyhodnotit, které části DNA se shodují ve vzorku kůže odebraném zpoza ucha.
Neměli obrázek kompletní hádanky jako referenční, ale mohli jej aproximovat pomocí techniky genomické analýzy (Hi-C). Kombinací Hi-C analýzy a sekvencováni DNA zmapovali 28 chromozomů pomocí moderního slona, který má také 28 chromozomů jako model.
Stav zachování chromozomů
Nejúžasnější aspekt studie se týká stavu zachování fosilizovaných chromozomů. V tiskové zprávě se uvádí: „Protože si zachovali obrovské množství fyzické integrity a detailů, včetně nano smyček.“ Vědci byli schopni říct, které geny byly aktivní a které neaktivní v jejich kožních buňkách. Tyto znalosti aplikují na další krok svého výzkumu: epigenetiku neboli genovou expresi.
Marti-Renom, odpovídající autor, uvedl v prohlášení: „Poprvé máme tkáň mamuta srstnatého, ze které přibližně víme, které geny byly aktivovány a které deaktivovány. „Jde o mimořádný nový typ dat a je to první měření buněčné specifické genové aktivity genů v jakémkoli starověkém vzorku DNA.“
Tým je přesvědčen, že právě tento výzkum může být pro obnovu vyhynulého druhu zcela zásadní.